Internacional: 3

– Conmebol Libertadores – 2023
– Copa Rio – 1952
– Taça Olímpica – 1949

Nacional: 6

– Campeonato Brasileiro – 1970*, 1984, 2010 e 2012
– Campeonato Brasileiro (Série C) – 1999
– Copa do Brasil – 2007

Interestadual: 3

– Copa da Primeira Liga (Sul-Minas-Rio) – 2016
– Torneio Rio-São Paulo – 1957 e 1960

Estadual: 33

– Campeonato Carioca – 1906, 1907**, 1908, 1909, 1911, 1917, 1918, 1919, 1924, 1936, 1937, 1938, 1940, 1941, 1946, 1951, 1959, 1964, 1969, 1971, 1973, 1975, 1976, 1980, 1983, 1984, 1985, 1995, 2002, 2005, 2012, 2022 e 2023

Outras conquistas:

Taça Guanabara: 10 (1966/1969/1971/1975/1983/1985/1991/1993/2012/2017/2022/2023).
Taça Rio: 2 (1990/2005/2018).
Torneio Início: 9* (1916/1924/1925/1940/1941/1943/1954/1956/1965).
Torneio de Verão (1973)
Torneio de Paris (1976)
I Copa Viña del Mar (1976)
Troféu Teresa Herrera (1977)
Torneio de Seul (1984)
Torneio de Kirin (1987)
Torneio de Paris (1987)
Torneio de Kiev (1989)

* Até 2011, o torneio se chamava Roberto Gomes Pedrosa, no entanto, a CBF reconheceu como Campeonato Brasileiro, tornando o clube tetracampeão nacional.

** Em 1907, Fluminense e Botafogo terminaram como maiores pontuadores, mas não houve uma final. Assim, o campeonato ficou sem campeão até 1996, quando a FERJ decidiu que ambos seriam considerados campeões.